우리의 코로나 뒤에 무엇이 있습니까?
MSNBC의 스테파니 룰(Stephanie Ruhle)은 UC 데이비스가 "매우 성공적으로 코로나 테스트를 통과했다"고 말하며 최근 공중보건학 부학장인 브래드 폴록(Brad Pollock) 교수와 대학의 코로나19 테스트 프로그램에 대한 인터뷰를 마무리했다.
타액 검사 프로그램은 학생들이 가을 분기에 캠퍼스 기숙사로 이사하기 시작한 9월 14일에 시작되었으며 이후 Healthy Davis Together를 통해 지역 사회에 봉사하도록 확장되었습니다.
이달 초 UC 데이비스 게놈센터는 10만 번째 타액 샘플을 테스트했다. 여기서 우리는 테스트의 배경이 무엇인지, 그리고 그것이 어떻게 결합되었는지 살펴보겠습니다.
"어레이 테이프" 기술을 사용하는 IntelliQube 고처리량 정량 PCR 기계는 테스트 프로그램의 핵심입니다. 샘플 튜브나 웰이 있는 플레이트 대신, 기계는 PCR 반응을 수행할 수 있는 수천 개의 작은 웰이 인쇄된 테이프를 분석합니다.
원래 농업 유전학에 사용하기 위해 개발된 어레이 테이프 기계는 의료 진단용으로 특별히 제작된 기계보다 훨씬 더 많은 수의 PCR 테스트를 하루에 수천 번 실행할 수 있습니다.
식물과학 교수이자 게놈센터 소장인 리처드 미셸모어(Richard Michelmore) 교수팀은 테스트 프로그램을 개발해 캠퍼스에 제안했다. 자금은 학생들이 도착하기 한 달 남짓 전인 8월 4일까지 이루어졌습니다. Michelmore는 "이로 인해 캠퍼스 전체에 엄청난 동원이 촉발되었습니다"라고 말했습니다.
검사는 튜브에 침을 뱉는 간단한 방법으로 이루어지며, 결과는 일반적으로 1~2일 이내에 통보됩니다. 이 검사는 COVID-19 증상이 없는 사람을 대상으로 합니다. 증상이 있는 학생은 학생 건강 및 상담 서비스에 가야 하고, 다른 학생은 의료 서비스 제공자에게 가야 합니다.
테스트를 위해서는 예약이 필요합니다. 이는 개별화된 바코드를 생성하는 온라인 프로세스로, 테스트를 위해 도착하면 샘플 튜브의 바코드와 일치됩니다. 물을 한 모금 마시고 다시 튜브에 떨어뜨린 후 뚜껑을 닫으면 작업이 완료됩니다.
신원이 확인되지 않은 바코드 튜브는 게놈 센터로 옮겨져 샘플이 열처리되어 모든 바이러스가 비활성화됩니다. SARS-CoV2 바이러스 입자는 타액에서 잘 생존한다고 Michelmore는 지적했습니다.
그런 다음 샘플을 파파인 프로테아제(육류 연화제라고도 함)로 처리하여 타액의 점도를 낮추고 384웰 플라스틱 플레이트로 옮긴 다음 자동으로 테이프로 옮깁니다. 반응에는 약 1시간 30분이 소요됩니다. 각 IntelliQube는 하루 12시간 동안 약 6,000개의 테스트를 실행할 수 있습니다. 결과는 클라우드 기반 UgenTech FastFinder 소프트웨어로 분석됩니다.
PCR 테스트는 식품의약청(FDA)에서 승인한 프로토콜에 따라 조정되었습니다. 이 실험실은 UC Davis 학생 건강 센터 실험실의 확장으로 CLIA 승인을 받았습니다.
이 테스트는 개인의 감염 가능성이 있는 한계점 이하인 마이크로리터의 타액에서 15개 정도의 바이러스 복사본을 검출할 수 있습니다. 처음에는 타액 검사를 동시에 채취하여 상용 실험실에서 처리한 비강 면봉과 비교했으나 타액 검사의 정확성이 확인되면서 중단되었습니다.
DNA 기술 핵심 관리자인 Lutz Froenicke가 이끄는 두 개의 별도 기술 직원 팀이 예비 팀을 백업으로 두고 서로 다른 날에 테스트를 실행하기 위해 노력합니다.
Michelmore는 UC Davis 병리학 및 진단검사의학과의 Ralph Greene, 학생 건강 및 상담 서비스 의료 책임자인 Cindy Schorzmann, UC의 Sheri Belafsky를 포함하여 테스트 프로그램을 시작하고 실행하는 데 "캠퍼스 전반에 걸친 막대한 노력"을 인정했습니다. 데이비스 의료 감시 프로그램 - 그리고 테스트 키오스크를 세우고 운영하고, 기계와 장비를 구입하고, 테스트를 실행하고, 결과를 분석하고 보고하기 위해 노력한 수많은 다른 사람들.
Michelmore는 다른 대학 및 기업으로부터 많은 문의를 받았지만 현재 용량 제한으로 인해 UC Davis, Davis, Yolo 카운티의 다른 위치 및 UC Merced 이상으로 테스트를 확장할 계획이 없다고 언급했습니다. 그러나 그는 프로토콜과 작업 흐름 중 어느 것도 특허를 받지 않았으며 다른 사람이 복제할 수 있다고 지적했습니다.